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    MIRA結合Cas12a快速檢測兒童呼吸道疾病

    急性呼吸道感染是兒童常見的呼吸道疾病,通常由病毒引起。呼吸道合胞病毒(RSV)和呼吸道腺病毒(ADV)是引起兒童急性呼吸道感染的兩種常見病原體。輕度者可引起常見的感冒症狀,如咳嗽和流鼻涕,而嚴重者可出現嚴重的併發症,如肺炎和中耳炎。根據世界衛生組織的建議,病原體的檢測需要具備快速、準確、敏感、特異性的特點,不應依賴專門的技術人員或大型儀器。因此,開發一種能夠滿足上述檢測要求的RSV和ADV的檢測方法尤為重要。

    深圳兒童醫院兒科研究所的馬東禮主任課題組在《Scientific Reports》期刊上發表文章《A multiplex recombinase polymerase amplification assay combined with CRISPR/ Cas12a for the detection of respiratory syncytial virus and respiratory adenovirus》,影響因子4.6。

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    研究概述

    多酶恆溫快速核酸擴增技術MIRACRISPR/Cas檢測系統相結合。顺利获得設計MIRA引物和CRISPR rna(crRNAs),多序列比較,優化反應條件,並使用熒光數值檢測裝置,驗證靈敏度和特異性。

    並且qPCR結果作為比較對照,研究了160例臨床咽拭子樣本的檢測結果的一致性。

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    (MIRA-CRISPR/Cas12a檢測法檢測步驟示意圖)


    實驗結果

    1. MIRA-CRISPR/Cas12a檢測方法靈敏度和特異性

    MIRA方法檢測中,使用RSV-F1/R1引物對從RSV、ADV、PIV、RhV、MP、CP、FluB、hMPV、FluA或RSV/ADV合併感染患者的咽拭子樣本中擴增核酸。除RSV和ADV有擴增條帶,其他結果均為陰性,說明所選MIRA引物與檢測的其他8種病原體未發生交叉反應,且保守性良好。

    隨後,使用無菌水對RSV和ADV重組質粒進行10倍梯度稀釋,對RSV和ADV的檢測限均為106copies/mL。

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    1-10:分別為RSV、RSV/ADV合併感染患者咽拭子樣本以及其他呼吸道病原體樣本

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    1-6:107102稀釋質粒DNA;7:陰性對照)

    2.與qPCR做對比

    qPCR方法相比,RSV和ADV的檢出限均為103copies/mL

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    (qPCR檢測RSV和ADV的靈敏度

           MIRA-CRISPR方法更適合基層實驗室,檢測時間短,操作簡單,無需大型qPCR儀器即可完成實驗操作。

    3.臨床樣本對比

    從急性呼吸道感染的兒童中採集咽拭子樣本160例。同時使用MIRA-CRISPR方法、qPCR方法進行檢測,並將結果與臨床試驗結果進行比較

    qPCR方法相比,MIRA-CRISPR方法RSV和ADV的敏感性分別為98.1%和91.4%,檢測特異性均為100%。Kappa值大於0.95,表明其一致性程度較高。

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    MIRA-CRISPR方法對RSV和ADV的檢測具備快速、靈敏、特異性強的優勢。它能及時準確地檢測到病毒感染,更加適合於醫療資源匱乏的地區使用

    (上述數據等信息均來源於原文,連結:http://www.ecttc.com/vip_doc/28304219.html)



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