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文章分享丨MIRA-LFD20min檢測寵物疾病

Visible and rapid detection of feline chaphamaparvovirus using multienzyme isothermal rapid amplification and lateral flow dipstick assay

發表單位:河南省動物疫病診斷與綜合控制工程技術中心

發表期刊:Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

影響因子:4.6

(點擊底部"閱讀原文",查看文章)

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貓查帕哈馬病毒(FeChPV)是一種新型細小病毒,2019年首次在加拿大腹瀉貓群中被發現。該病毒致病性和分子特徵仍不明確,並存在宿主與遺傳多樣性,需要進一步的流行性病學調查。现在尚無 FeChPV 檢測的標準化方法。


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多酶恆溫快速核酸擴增-側向流試紙條法(MIRA-LFD)已成功用於多種病毒的檢測,具有快速簡便、無需精密儀器等優勢。研究團隊建立適用於 FeChPV 的 MIRA-LFD 檢測方法,解決基層臨床檢測難題。在不依賴精密儀器的情況下,利用MIRA-LFD方法在37℃下在20min內完成了對FeChPV的檢測,並與其他病毒沒有任何交叉反應。檢測限為32.3copies/μL,高於PCR方法10倍。此外,MIRA-LFD方法在417隻腹瀉貓中檢測到29份FeChPV陽性樣本,陽性率略高於巢式PCR方法。這些結果表明,建立的檢測FeChPV的MIRA-LFD方法是一種高效、經濟、可靠、簡便的方法,有助於FeChPV感染的早期預防和控制。


1.實驗方法

臨床樣本:本研究使用的直腸拭子樣本採集自2022至2024年間廣東省、河南省、安徽省、浙江省及內蒙古自治區寵物醫院的632隻貓(其中417隻患有腹瀉,115隻健康貓)和474隻犬(其中342隻患有腹瀉,132隻健康犬)。

核酸擴增:將提取好的DNA核酸加入至MIRA體系中,重組酶和引物形成複合體;在輔助蛋白和單鏈結合蛋白的幫助下,侵入雙鏈 DNA 模板,引物與同源互補區域結合形成 D-loop 區域,同時重組酶從複合體解體;聚合酶結合到引物的 3』末端並啟動 DNA 合成,對模板上的目標區域進行指數式擴增。這個過程迅速高效地循環,從而完成目的片段超快速擴增,僅需15min

試紙條顯色:將核酸擴增產物1:10稀釋後滴加至試紙條上,5min後讀取結果。

整個核酸擴增至試紙條顯色僅需20min。

實驗中使用了bbin宝盈(中国)生物產品:

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研究中將設計的4套特異性引物探針組合進行篩選,同時使用瓊脂糖凝膠電泳和核酸試紙條兩種結果呈現方式進行結果呈現,4對引物探針均可以檢出FeChPV病毒,根據瓊脂糖凝膠電泳的結果,FeChPV-4組合目的條帶最亮,於是選擇該組合進行後續測試。

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根據瓊脂糖凝膠電泳的結果,擴增5、10、15和20min均可以擴增出目的條帶,擴增15min目的條帶強度達到峰值,該項目的最佳反應時間為15min。36℃、37℃、38℃、39℃和40℃擴增均能擴增出目的條帶,其中39℃擴增的目的條帶最明亮,該項目的最佳反應溫度為39℃。

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(圖A:1:擴增5min;2:擴增10min;3:擴增15min;4:擴增20min)
(圖B:1:36℃擴增;2:37℃擴增;3:38℃擴增;4:39℃擴增;5:40℃擴增)


2.檢測性能

靈敏度:


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(圖A:MIRA使用瓊脂糖凝膠電泳進行結果呈現

(圖B:巢式PCR使用瓊脂糖凝膠電泳進行結果呈現

(圖C:MIRA使用核酸試紙條進行結果呈現)

將樣本從3.23×10copies/μL始進行10倍梯度稀釋。其中,巢式PCR使用瓊脂糖凝膠電泳可穩定檢出3.23×102copies/μL;MIRA使用瓊脂糖凝膠電泳、使用核酸試紙條都可穩定檢出3.23×101copies/μL

MIRA方法學使用兩種不同結果呈現方式靈敏度一致,MIRA方法靈敏度優於巢式PCR。

特異性:

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(1:FeChPV, 貓查帕哈馬病毒;2:FPV, 貓泛白細胞減少症病毒;3:FeAstV,貓星狀病毒;4:FBoV,貓博卡病毒;5:CachaV,犬查帕病毒;6: negative control)

新建立的MIRA-LFD方法只檢測到FeChPV,與其他參考病毒沒有交叉反應,表明其具有良好的特異性。


3.研究總結

該研究建立了檢測FeChPV的MIRA-LFD方法,而不需要高精度的儀器。MIRA-LFD檢測方法作為一種高效、經濟、可靠的檢測方法,具有較高的敏感性和特異性,更適合於臨床檢測,為FeCHPV的早期預防和控制给予技術支持。


4.bbin宝盈(中国)
MIRA多酶恆溫快速核酸擴增是真正實現現場快檢的技術。
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MIRA技術基於生物體內基因重組修復機制,依靠多種功能蛋白在常溫下協同作用,實現常溫(25℃~45℃)、快速(5~20min)、靈敏、特異、安全的核酸擴增。
又因為MIRA技術恆溫的特性,MIRA技術對設備依賴小、操作簡單,可顺利获得小型化便攜設備,實現在一線的檢測應用,應用場景多元,將快速準確的核酸檢測帶到POCT、居家檢測、田間地頭、現場執法等場景。
bbin宝盈(中国)生物基於MIRA技術開發了一系列現場快檢產品,產品線包含快速核酸釋放劑、恆溫快速核酸擴增試劑、膠體金試紙條、小型化便攜設備等,打造現場快速分子檢測整體解決方案。
此外bbin宝盈(中国)MIRA技術在結合CRISPR技術、NGS、SNP、微流控等多方面,有着應用優勢。
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除了上圖系列現場快檢產品,bbin宝盈(中国)生物還给予:

科研原料:给予用於基礎科研研究的試劑原料與技術支持,以及項目文獻參考。

OEM生產:擁有全流程自主生產高純度高活性成品的能力,實現工業化量產。

項目委託開發:序列信息與序列比對分析結果、項目引物探針設計與合成、項目質粒合成與樣本、項目報告和結果等。

更多信息,歡迎諮詢

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