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海外科研新進展丨MIRA技術檢測諾如病毒可視化裝置

《Hybrid paper/PDMS microfluidic device integrated with RNA extraction and recombinase polymerase amplification for detection of norovirus in foods》

期刊名稱:《Applied and Environmental Microbiology》

影響因子:3.9

研究團隊:麥吉爾大學戴維斯夫人研究所病毒性疾病中心

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諾如病毒((HuNoV))屬於杯狀病毒科,可通過受污染的食物傳播,是引起急性胃腸炎的主要原因。

加拿大麥吉爾大學戴維斯夫人研究所病毒性疾病中心聯合發表了相關檢測研究。課題組開發了一種摺紙微流控裝置,使用小鼠諾如病毒1(MNV-1)作為諾如病毒的替代品。該摺紙微流控裝置通過試紙條吸收RNA,使用MIRA多酶恆溫快速核酸擴增技術進行RNA擴增,以及試紙條橫向流動分析。整個檢測過程和結果可視化,檢測在35 min內完成,且特異性100%、檢測限為200 PFU/mL。該裝置在偏遠和資源環境中檢測農業食品中的食源性病毒方面具有巨大的潛力。

實驗方法

纖維素紙條吸收了MNV-1 RNA,隨後將其釋放到MIRA試劑中,RNA首先被逆轉錄成互補DNA(cDNA),然後擴增成雙鏈DNA(dsDNA),接着探針與目標序列進行了特異性的結合,鹼性四氫呋喃(THF)殘基被內切酶IV裂解,使鏈被聚合酶延伸。擴增子被捕獲,在T線上產生視覺信號。

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實驗開發成果

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課題組開發了一種摺疊的紙/PDMS微流控裝置,該裝置結合了核酸提取、等溫核酸擴增、可視化檢測多種功能,可以無縫集成從樣品製備到MNV-1的終點檢測。

該微流控裝置在35 min範圍內完成檢測,檢測限均為200 PFU/mL。並且每個微流控設備的成本計算為6.76美元,為課題組目前已知的所有檢測方法中最便宜的。


實驗價值

課題組進一步評估了這種微流控裝置在萵苣和覆盆子中檢測MNV-1的性能,將粗MNV-1 RNA提取物引入新鮮農產品樣品中,不需要複雜的病毒RNA濃度和純化步驟,在生菜中檢測到170 PFU/g、在樹莓中檢測到230 PFU/g。

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而傳統的檢測食品中病毒的分子分析方法,PCR和qPCR需要高純度的病毒顆粒,這使病毒從食品基質中的洗脫、濃度和純化變得複雜。並且傳統方法需要複雜、笨重和昂貴的設備,不適合在資源有限的環境中使用。

該裝置在快速檢測食品供應鏈中的HuNoV和其他食源性病毒方面具有重要價值。

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